Unit Pentadbiran diketuai oleh En. Mustafar Kamar Bin Ujang selaku Pengarah Politeknik Kota Kinabalu dan dibantu oleh En. Razak Bin Sadli selaku Timbalan Pengarah Akademik dan En. Dullah Bin Muluk selaku Timbalan Pengarah Sokongan Akademik. Unit Pentadbiran melaksanakan semua urusan Perkhidmatan dan Perjawatan, Pentadbiran Am dan Kewangan.